Статья посвящена информационному контексту распознавания паттернов искусственности (паттернов дизайна). Статью можно прочитать здесь.
Автор, на мой взгляд, неправ, утверждая, что контекст неважен. Напротив, информационный контект имеет исключительное значение. Без контекста функциональная строка или иная конфигурация рассматриваемой системы — лишь одна из теоретически возможных. Более того, вне контекста вероятность появления данного символа алфавита мощности N в заданной позиции строки такая же, как и вероятность любого иного символа, а именно: 1/N.
Лишь рассмотрение контекста привносит в дизайн-распознавание конкретный прикладной смысл. Что касается генетического и эпигенетического кода, то контекст, в котором следует рассматривать последовательность нуклеотидов, представляет собой биологическую функцию в контексте функционального протеома. В частности, именно на использовании контекста основан метод Дерстона [Durston et al. 2007] подсчета количества функциональной информации, несомой отдельным конкретным аминокислотным остатком в заданной позиции последовательности аминокислот «работающей» белковой молекулы (см. также мою записку).
Литература
- Durston, K.K., D.K.Y. Chiu, D.L. Abel and J.T. Trevors (2007), Measuring the functional sequence complexity of proteins, Theoretical Biology and Medical Modelling 4:47. [doi:10.1186/1742-4682-4-47]
No comments:
Post a Comment